¿Cómo podría aprender bioinformática como estudiante de biología?

Answer 1

¡Ve a por ello!

Primero, decide a qué te refieres con aprender bioinformática. No se pretende que sea lo contrario, es solo que el campo tiene un gran alcance y sigue creciendo.

Obtenga una familiaridad básica con Python o R: esos son los idiomas dominantes para la bioinformática. Eso no quiere decir que se usen muchos otros idiomas e importantes, pero son muy buenos. Además, una vez que los aprendas, descubrirás que la mayoría de los otros son similares (¡puedes decir que muestran mucha homología!) ).

¡Escribe tu propio código Smith-Waterman – en serio! Normalmente no uso el mío, pero el ejercicio vale la pena, realmente entenderás este algoritmo clave si escribes uno. Necesito hacer esto otra vez; No soy bueno en eso y caigo en trampas cada vez. Pero es como cualquier ejercicio físico; Te beneficias del esfuerzo. Luego, si lo escribió con recursión, vuelva a escribirlo utilizando solo bucles, o viceversa

Con regularidad, elija un papel de un diario o BioRxiv y realmente profundice en él. ¿Cuál es el problema que intentaban resolver? ¿Se puede escribir pseudocódigo para abordar el problema. Un lugar para buscar este tipo de cosas es en mi blog, ya que periódicamente entro en papeles (tengo algunos a fuego lento, espero que en algún momento de mayo salga al menos uno más). Incluso dibujé un problema completo y cómo trabajarlo, que incluye un enlace a un documento.

Pinniped Karyotypes & N50 Statistics

Andamios de escala cromosómica y el estado del ensamblaje del genoma

Empaquetado de enzimas novedosas a través de la metabolización masiva

Trabaje con algunas notas de cursos en línea: esto es solo una muestra de algunas buenas (realmente debería hacer un archivo de enlaces a tales)

Curso de modelado basado en restricciones

Michael Schatz CSHL, Genómica Aplicada

Aaron Quinlan, U.Utah genómica computacional aplicada

CS262 – Genómica Computacional

El campo de publicación realmente no ha continuado, o no lo he hecho, pero los oldies-but-goodies son realmente muy buenos

Análisis de secuencias biológicas: modelos probabilísticos de proteínas y ácidos nucleicos: 9780521629713: Libros de medicina y ciencias de la salud en Amazon.com

Amazon.com: Time Warps, String Edits y Macromolecules: la teoría y la práctica de la comparación de secuencias (9781575862170): David Sankoff, Joseph Kruskal: Libros

Biología molecular computacional

Answer 2

Gracias por A2A,

Tienes una respuesta increíble por Keith Robison. Voy a proporcionar algunas de mis ideas

Sumergiéndonos en la genética y la genómica.

Este es un blog de un biólogo especializado que, en el transcurso de 4 años, se ha convertido en bioinformático mientras cursa un doctorado. Es un blog increíble y también el post de github. Debería inspirar a mucha gente.

Luego siga las publicaciones de blog de expertos para comprender el campo de la genómica y cómo trabajar con datos.

Interesantes blogs de bioinformática (edición 2017).

¿Cómo pasar de la investigación de banco a la biología computacional?

¿Cómo puede un biólogo aprender bioinformática sin asistir a cursos formales?

Aprendiendo Bioinformática | The Scientist Magazine®

Pero lo primero y más importante es lo que quiere hacer en el campo de la Bioinformática y qué tipo de investigación de Bioinformática le está intrigando a usted para que lo busque. El campo es gigantesco y debe ser un poco específico a lo que concierne a su interés. ¡Buena suerte!