¿Cuáles son los mejores recursos para prepararse para el modelado de proteínas en las Olimpiadas de Ciencia?

Answer 1

3-D Molecular Designs vende un kit de precompilación con un toober que siempre tiene la longitud correcta: Kits de modelado de proteínas de la Olimpiada de Ciencias

Science Olympiad usa estos tipos de kits para la compilación en el sitio, pero también puede adaptar otros kits de modelado de proteínas o construir uno propio (vimos a alguien usar limpiadores de pipetas). Las adiciones creativas pueden estar hechas de cualquier cosa siempre que las expliques claramente.

También he encontrado útil esta guía rápida para JMol: http://blc.arizona.edu/courses/mcb184/graphics/JmolQuickReferenceSheet.pdf

En cuanto a la parte de la prueba escrita de PM, el sitio de la Olimpiada de Ciencias de CBM (MSOE Center for BioMolecular Modeling) es útil para obtener información de antecedentes y consejos sobre dónde comenzar a construir. Más allá de eso, querrás investigar más sobre tu proteína. Las publicaciones científicas de código abierto son una buena fuente de información y son una forma fácil de descubrir aminoácidos funcionalmente importantes para las “adiciones creativas”.

Answer 2

Lea todo sobre esto para la elección múltiple del Centro MSOE para el modelado biomolecular

(probablemente lo sabias)

http://cbm.msoe.edu/scienceOlymp …

Mire a través de la base de datos de proteínas para encontrar una proteína y use jmol para que se vea bien. Muy entretenido si alguna vez te aburres, o si quieres saber si el tRNA parece un T. Practica mucho con jmol.

Resulta que en San Diego, al menos, esto no es necesario, pero es muy atractivo para el aprendizaje de los aminoácidos.

Realice pruebas de práctica en scioly, pero diferentes regiones del país tienen estilos de prueba completamente diferentes. O MSOE Center for BioMolecular Modeling

En algún lugar, probablemente en el sitio de modelado de proteínas, hay algo sobre cómo califican a los modelos. Tenga cuidado de que sus hélices sean diestras y que todo lo que se supone que sea paralelo sea paralelo. Probablemente hay más. Aprende cómo usar jmol, sin marearte ni desorientarte.

Mi cosa favorita de jmol era 1.0 backbone, spacefill off. La estructura alámbrica es útil para determinar la orientación de aminoácidos importantes. Es posible que desee colorear los aminoácidos que se supone que debe adjuntar.

Eso servirá. Jmol, lee el sitio.