¿Cuáles son algunos buenos recursos para aprender sobre biología sintética?

El sitio web de la fundación Biobricks biobricks.org/ tiene enlaces a una gran cantidad de recursos académicos y afiliados al MIT, como iGEM y el registro de piezas.

El sitio del instituto de Craig Venter www.jcvi.org/ tiene mucha buena información sobre los aspectos técnicos de su trabajo y las últimas noticias en este campo.

El sitio de la compañía de Venter www.syntheticgenomics.com/ tiene información, pero los enfoques de aplicación de la compañía no están ridículamente extendidos … todavía.

El Instituto de Biología de Sistemas www.systemsbiology.org/ está haciendo un gran trabajo, especialmente en el campo de la computación. También ha generado algunas empresas.

No soy una persona de Twitter, pero aparentemente hay una cuenta de Twitter llamada “Noticias de biología sintética” http://twitter.com/#!/SynBioNews

Otras empresas que hacen biología sintética:

  • Amyris www.amyris.com
  • Energía Zafiro www.sapphireenergy.com
  • Ginko Bioworks http://ginkgobioworks.com/
  • Cellerant Therapeutics http://www.cellerant.com/: puede considerar que lo que están haciendo es biología sintética.

Biología sintética: Una cartilla es un gran libro para aprender lo básico.

Como mencionó Justin, una vez que comience, puede usar un sitio como Benchling para diseñar experimentos. Es una plataforma gratuita basada en la web para el análisis de ADN y la toma de notas. Tenemos algunos tutoriales disponibles que pueden ponerlo al día sobre cómo trabajar con el ADN, los conceptos básicos de la clonación y el análisis de secuencias.

Sitios web de biología sintética.
http://syntheticbiology.org/
http://openwetware.org/wiki/Main

Editor de ADN
Benchling · ADN simplificado: este software es asombroso si está trabajando en biología sintética.

Próxima conferencia
synbioconference.org – La conferencia Biología Sintética: Ingeniería, Evolución y Diseño (SEED) se llevará a cabo anualmente y rotará entre ciudades.

Un campo interesante que combina la informática con la biología sintética es la automatización del bio-diseño. Implicaba la creación de algoritmos para el diseño por computadora y la construcción planificada de circuitos sintéticos. Recomiendo la IWBDA, una conferencia anual centrada en el tema: Taller internacional sobre automatización de Biodesign

Otra comunidad interesante de informáticos, ingenieros y biólogos está desarrollando SBOL, una ontología para describir circuitos sintéticos: Biología sintética Lenguaje abierto

J. Chris Anderson (UC Berkeley) tiene un gran conjunto de conferencias sobre biología sintética que abarcan gran parte de la amplitud del campo. Es el mejor conjunto de conferencias que conozco. Él usa mucho de este material en sus cursos de Laboratorio de Biología Sintética y Dispositivos Genéticos.
Conferencias: J. Christopher Anderson
Algunas de las cosas que cubre son: biología esencial y química orgánica, enzimas de manipulación de ADN, chasis, abstracción de partes / dispositivos, software, evolución dirigida, bibliotecas combinatorias, automatización, optimización metabólica, ortogonalidad, megasíntesis, modelos y cinética transcripcional y traslacional, transcripción y circuitos bioquímicos, interacciones microbianas, procesos y dispositivos; Refactorización, dispositivos eucariotas y de desarrollo, y más.

También tiene algunos tutoriales de diseño útiles aquí: Arking: JCAOligoTutorialHome – OpenWetWare

Uno de sus alumnos graduados tiene un canal que cubre las técnicas de wetlab : https://www.youtube.com/user/bio

Adam Arkin (Berkeley) y Ron Weiss (MIT) han enseñado Principios de biología sintética durante muchos años, y ahora está en edX. Es más estrecho en amplitud y se expande más a las perspectivas de biología física y de ingeniería eléctrica de los profesores, respectivamente. Curso: Principios de biología sintética.

Material del curso para un seminario de bio bio enseñado en UT: CH391L / S13 – OpenWetWare

Regenesis , escrita por George Church de Harvard, es un gran libro que ofrece una buena visión general de la biología sintética y sus posibles aplicaciones futuras. Cubre temas desde la vida del espejo hasta iGEM, y como estudiante que espera involucrarse en la biología sintética, me pareció una lectura realmente interesante y útil.

A mi mismo me encantaría saber más sobre estos temas, pero para comenzar, se podría usar la introducción de Scott a la biología sintética. Es un recurso gratuito. (Podrías buscarlo en google). Además, hay algunos cursos listados en Open Wet Ware.

Esto es solo para hacer rodar la pelota.

Definitivamente echa un vistazo a Genspace! http://www.genspace.org/
Son anfitriones de un montón de eventos y charlas realmente interesantes, y también tienen equipos de iGEM (competición de biología sintética) de escuela secundaria y de licenciatura. De hecho, tienen una próxima clase de “Introducción a Syn Bio” – Introducción a la biología sintética

Les presento el subreddit de Biología Sintética. Aquí hay una pregunta similar con un gran hilo de cómo comenzar:

Biología sintética de IWTL y cómo escribir programas genéticos utilizando Biobricks.

Internet – ¡Cursos! Principios eDX de biología sintética Un MOOC gratuito, que comienza el 4 de enero de 2016.

Aquí hay una instantánea estática a partir de 2012

http://www.plosone.org/article/i

Acabo de descubrir esto y es increíble.
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Tiene tendencias sobre nuevos documentos, fondos y datos de citas. También se ve increíble.

Disfruto de esta fuente. Parece que se actualiza diariamente:

El SynBioLogist

http://paper.li/Socrates_Logos/1

Optogenética! Es tan sexy que te olvidarás de las personas del género que te atraen …