En el modelo de pudín de ciruela, el átomo se modeló como una esfera de carga positiva con electrones distribuidos uniformemente dentro de la esfera. Los resultados del experimento Geiger-Marsden se realizaron (bajo la dirección de Rutherford) no fueron consistentes con las predicciones del modelo de pudín de ciruelas, lo que demuestra que no fue correcto.
En el famoso experimento, se dirigió un haz de partículas alfa a una lámina de oro, y luego se midió la intensidad de las partículas alfa dispersas en diferentes ángulos. El experimento detectó una dispersión muy significativa en grandes ángulos.
El modelo de pudín de ciruela, por otro lado, predijo solo una ligera desviación del haz de partículas alfa dispersas. No hay gran ángulo de retrodispersión. Estos resultados demostraron que el modelo de pudín de ciruela era incorrecto.
El gran ángulo de retrodispersión sugirió a Rutherford que el átomo en realidad tenía un pequeño núcleo con carga positiva. Rutherford modeló la interacción de las partículas alfa con el núcleo de los átomos de oro que implicaba solo la repulsión de sus cargas eléctricas. La fórmula que Rutherford derivó de este modelo coincidió con los datos experimentales, confirmando así su modelo.
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Una buena discusión histórica está aquí: Dispersión de Rutherford