Filia significa amistad en griego. Entonces, ¿por qué philanderer significa coquetear y filosofía significa amor por la sabiduría?

Usted ha declarado correctamente el origen de estas palabras como griego. Sin embargo, las interpretaciones y los contextos son algo diferentes.
Toma la palabra philia. Esta palabra no se usa de forma independiente. Es una palabra de forma combinada. es decir, se combina con otro para dar un significado de “Atracción poco común o no natural”. Tomando un ejemplo, la palabra ‘demophile’ Esto significa un amor por la multitud o el amor por la gente alrededor. Una persona que colecciona libros para un amante de los libros se llama “bibliófilo”. Por lo tanto, la palabra philia o es una combinación que forma otra palabra que significa amor antinatural o excesivo sobre una cosa en particular.

El origen de la palabra philanderer tenía un significado diferente. Se usaba en el contexto de una mujer que ama a su esposo. Sin embargo, durante un período de tiempo, adquirió diferentes connotaciones. Ahora se está utilizando para referir a una persona, un hombre que ama a una mujer con quien no pretende casarse. En otras palabras, coqueteando. El origen griego de esta palabra es ‘philandros’ (y no ‘philia’) significa alguien que ama.
La palabra filosofía es una combinación de palabras philia y sophy. La palabra philia se explica arriba. La palabra sophy tiene su origen en latín. Significa hombres sabios. Por lo tanto, la combinación derivada es Filosofía que significa amor por el estudio o búsqueda profunda de cualquier rama de la ciencia.
El significado del diccionario de esta palabra es, –
el estudio crítico de los principios y conceptos básicos de una rama particular del conocimiento, especialmente con miras a mejorarlos.

Aquí hay algo que encontré en dictionary.com y algunos sitios aleatorios en la web:
1675-85;
Phílandros griego uno que ama (de una mujer, amando a su marido); luego
utilizado en la ficción como un nombre propio para un amante, y aparentemente confundido con “un hombre que ama”