Francis Bacon es usualmente nombrado como el “padre del método científico”. Su énfasis estaba en el escepticismo como una fuerza constructiva: que no hay verdad cierta, y que todas las teorías deben ser cuestionadas y probadas por el experimento. (En oposición, por ejemplo, a Descartes, quien creía que podíamos llegar a la certeza por pura razón).
“Si un hombre comienza con certezas, terminará con dudas; pero si se contenta con comenzar con dudas, terminará con certezas”. – Tocino
El método científico moderno ha evolucionado bastante desde entonces, pero su énfasis en el experimento como prueba de la verdad sigue siendo un principio central. Si tiene que elegir un momento en el tiempo en que comenzó la ciencia, cuando la ciencia se separó de la religión, entonces Bacon es una buena opción.
Bacon era un cristiano devoto, por lo que no habría visto su trabajo como una respuesta a la religión. Pero creía mucho que la superstición era perjudicial, y veía su ciencia (o filosofía natural, como se llamaba entonces) como una respuesta a la superstición, y una manera de atraer a los hombres a la verdadera religión.
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Sin embargo, simpatizaba más con el ateísmo que muchas personas en su época. Veía al ateísmo como menos dañino que las formas supersticiosas de la religión.