Hay literalmente docenas de métodos para calcular la distancia genética.
Sin embargo, en la forma más simple, no es muy diferente de contar diferencias.
Por ejemplo:
La distancia a AAAA desde
AAAG es 1
AAAC es 1
AAGG es 2
Creo que la distancia que he descrito es la distancia de Manhattan (que no es inherentemente una distancia genética).
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Se complica, rápidamente. Se complica porque
1. La idea de “distancia” es muy compleja incluso en las matemáticas estándar, especialmente cuando tienes múltiples dimensiones
2. La biología de la genética significa que un cierto tipo de mutación debe contar más que otro
3. Además, la distancia puede no reflejar una relación, es decir, el proceso de evolución que ocurrió. ¿Es por herencia, mutación o selección? Puede comenzar a introducir modelos biológicos en su definición de “distancia”.
La medida de distancia preferida dependerá del propósito del proyecto. Sin embargo, al final del día, es solo la distancia, lo que todos tienen un sentido intuitivo de lo que es eso.
Fuente adicional:
Lect. 6. Las distancias genéticas.