¿Qué conocimiento biológico se necesita para aprender bioinformática?

Answer 1

Comencé a estudiar bioinformática después de haber conocido una cantidad relativamente grande de biología molecular, bioquímica y medicina humana.

Diré que, en realidad, me sorprendió mucho la precisión con la que los biólogos computacionales pudieron descubrir cosas en las bases de datos genómicas / transcriptómicas que los biólogos moleculares tardaron muchos años en descubrir en el laboratorio húmedo. Aunque, por supuesto, los biólogos moleculares eran necesarios para probar la causalidad.

Si su metodología estadística es sólida y sus métodos computacionales también lo son, el concepto más importante es el dogma central de la biología molecular, que se relaciona con la transferencia de información que se produce desde el ADN al ARN a una proteína completamente funcional (interesante, ya que comparte algunos paralelismos con cómo funcionan nuestras computadoras).

De lo contrario, admito que creo que la mayoría de los bioinformáticos que conozco aprenden su biología a medida que avanzan, y no hay nada de malo en eso.

Si está interesado en una introducción (en realidad trato de no aconsejar sobre textos que no son muy bien aceptados), disfruté mucho lo siguiente y lo he estado recomendando a aquellos que pueden encontrar valor en él. Cuenta con una excelente mezcla de informática y biología molecular:

Algoritmos de bioinformática, un enfoque de aprendizaje activo, 2ª ed. Vol. 1: Phillip Compeau, Pavel Pevzner: 9780990374619: Amazon.com: Libros

Answer 2

Mientras más, mejor. Pero puedes empezar con nada. A medida que entras en la interpretación más extensa de los datos, la biología se vuelve más importante. La biología molecular es fácil y obvia: si diera un consejo, pongo más énfasis en la genética clásica, la genética cuantitativa y la estadística estadística. Y hacer algo para aprender sobre los fenotipos. Los puntos ciegos más grandes hoy en día provienen del énfasis excesivo de la genética molecular.

¡La mayoría de los pioneros en bioinformática no tenían antecedentes en biología!

David Haussler

Margaret Oakley Dayhoff

Eric Lander

Answer 3

Las buenas notas del curso o las publicaciones del blog describirán la biología básica que está siendo abordada por un problema; sumergirse en Wikipedia o encontrar algunos artículos de revisión en PubMed a menudo puede terminar el trabajo. Trabajar de abajo hacia arriba desde un buen libro de texto también es útil; Dependerá mucho de tu estilo de aprendizaje personal.

Encontrará algunas buenas notas del curso en mi respuesta a ¿Cómo podría aprender bioinformática como estudiante de biología?

Answer 4

Acabo de leer un libro de texto introductorio de nivel universitario sobre genómica. Te familiarizará con la terminología y cómo funcionan las técnicas básicas desde el aspecto científico. A menos que esté dirigiendo un laboratorio de bioinformática, puede hacerlo haciendo bioinformática sin mucho conocimiento de la ciencia subyacente y lo aprenderá leyendo libros relevantes.

Answer 5

Depende de lo que quiera hacer exactamente y de su comprensión de la genética molecular.

Generalmente,

Necesitará saber cómo se replica el ADN para que pueda comprender cómo pueden salir mal las cosas durante el proceso y por qué a veces es importante, pero a veces no es así (Mutaciones). Después de eso, probablemente querrá saber acerca de los exones e intrones y cómo diferentes combinaciones de exones le dan diferentes isoformas del mismo gen (Recombinación). Además, necesitas saber cómo se transmiten los genes a través de generaciones (herencia).

Answer 6

Solo biología molecular, o un máster de doctorado en bioinformática, a menudo en esos programas te preparan con la información que no has aprendido. Si vienes de una licenciatura en ciencias sociales, te enseñan lo que necesitas, si obtienes una licenciatura en biotecnología. Te enseñan lo que necesitas, etc.

En general trabajará con un equipo interdisciplinario. Pero si quieres estudiarte a ti mismo ve a Biología Molecular y Genómica.

Answer 7

No tengo experiencia en CS, pero he aprendido biología molecular en una universidad.

En resumen, es probable que no pueda “solo” estudiar biología molecular, que suele ser un curso de división superior. Probablemente tengas que pasar primero por la biología general si aún no lo has hecho, y la genética también puede ser un requisito previo (también necesitarás algún tipo de experiencia en estadísticas, pero supongo que no será una problema para usted). Si no tienes que tomar Genética, te lo recomiendo de todos modos.

Pero el mejor consejo que puedo dar sería hablar con un profesor de tu universidad que haya asesorado a estudiantes interesados ​​en bioinformática antes (¡o hablar con varios profesores!). Probablemente hayan ayudado a varios estudiantes como tú antes, y saben lo que te espera.