¿Las cadenas de ADN tienen que ser antiparalelas para que se formen enlaces de hidrógeno?

No. Las hélices AT de doble cadena paralelas se predijeron sobre la base de la construcción de modelos en 1986 [1]. El modelo propuso que el emparejamiento “Watson-Crick inverso” podría acomodar una doble hélice paralela

Combinaciones antiparalelas y paralelas de ‘caras’ de pares de bases de adenina (A) y uracilo (U): (a) el par antiparalelo Watson-Crick A – U con caras opuestas (sombreadas versus sin sombrear) y un estiramiento de 1.5 Å introducido para separar las dos marcos de referencia de base; (b) el par de Hoogsteen A + U en paralelo con caras de pares de bases del mismo sentido. Los puntos negros en las bases denotan los átomos C1 ‘en los azúcares unidos [2].

Se han observado oligómeros AT paralelos en solución mediante espectroscopia UV y CD [3]. Los cálculos ab initio sugieren que los tautómeros de pares de CG también deberían poder formar hélices paralelas [4]

Notas al pie

[1] ¿Puede la doble hélice ser paralela?

[2] Página de inicio de 3DNA – Estructuras de ácidos nucleicos

[3] ADN de cadenas paralelas con apareamiento de bases AT

[4] Pares de guanina-citosina base en ADN de hebra paralela: un estudio inicial del par de bamboleo ceto − amino frente al par de tautómeros menores enol − imino

Sí. Esto se debe simplemente a las propiedades físicas de los ángulos de enlace de las diversas bases en la secuencia de ADN. En general, cualquier Purina y Pirimidina pueden unirse con H, pero no en el contexto del resto de la estructura de la molécula de ADN.