En los mamíferos, en la unión del intestino grueso y delgado hay un bolsillo ciego llamado ciego que recibe quimo del íleon y también es donde se adjunta el apéndice. En algunos mamíferos, aquí se cultivan bacterias que descomponen aún más la celulosa para liberar nutrientes. Sin embargo, hay algo de problema con esta orientación. El intestino delgado es el sitio de la captación de nutrientes, el intestino grueso principalmente solo toma agua, y el flujo de material digerido procesado es (en individuos sanos típicos) unidireccional desde el intestino delgado hasta el intestino grueso. Por lo tanto, todos los nutrientes liberados por las bacterias en el ciego ya han pasado el punto en que serían de alguna utilidad para el organismo huésped … a menos que el organismo huésped volviera a ingerir este material pasado. Hay numerosos mamíferos que hacen esto de manera rutinaria, la masa nutritiva que pasan es realmente diferente al material totalmente digerido, y se llama cecótrofos (o cecótropos) en oposición a las heces.
En los herbívoros, gran parte de la digestión de la materia vegetal no se realiza en realidad por el propio animal, sino por los microbios en el tracto digestivo. Los mamíferos y las aves alimentan a sus crías y, por lo tanto, tienen los medios para inocular directamente el aparato digestivo de sus descendientes con algunos (si no todos) de estos microbios. Los reptiles herbívoros suelen ser capas de huevos que muestran muy poco o ningún cuidado de los padres, generalmente los huevos se depositan en un nido y se dejan valer por sí mismos, por lo que el tipo de inoculación que podría tener lugar en mamíferos y aves no es posible. En cambio, los jóvenes típicamente buscarán las heces de los miembros mayores para consumirlas con el mismo propósito.
Similar al escenario de los reptiles herbívoros, se ha especulado que algunos animales, después de experimentar una enfermedad que ha interrumpido su biota gastrointestinal, consumirán las heces de otros en un intento de restablecer las colonias adecuadas.
Como Brendan Glackin ha indicado, muchos animales son bastante deficientes para digerir algunas de las cosas que comen, por lo que gran parte de ellas pasan sin ser digeridas. Otros animales aprovechan esto como fuente de nutrición.