No, por muchas razones.
a) Histórico: el átomo ha sido conocido por ese nombre durante siglos, y usted está sugiriendo que llamemos a otra cosa un átomo, y que se nos ocurra un nuevo nombre para lo que solía ser un átomo, y que no confundamos a todos en el proceso.
b) Por disciplina científica: el átomo, aunque como lo señala correctamente es divisible en partes subatómicas, actualmente constituye un punto de ruptura conveniente entre la física de partículas y la química: el átomo, si lo desea, sigue siendo la unidad fundamental e indivisible de química, biología y química. La mayor parte de la física clásica.
c) Estabilidad: la gran mayoría de lo que observamos a nuestro alrededor son átomos, no partículas subatómicas separadas. O esas partículas subatómicas por sí mismas son inestables y se descomponen, o se combinan en una forma estable que llamamos, lo adivinaste, ¡átomos!
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Los antiguos griegos nos trajeron “átomo”, pero los romanos nos trajeron “sub”, y podrías pensar que subatómico es un oxímoron, excepto que “sub” también tiene una interpretación de “debajo” o “debajo”, lo que implica que hay una Teoría que sustenta las propiedades atómicas, de la que emerge la teoría atómica (la tabla periódica, etc.).
Entonces, si bien técnicamente quizás tenga un pequeño punto, es un punto de selección de nudos, que si se resuelve crearía tremendos problemas y confusión en la semántica de nuestro lenguaje cotidiano.
Es mejor cambiar el enfoque pragmático y aceptar que el significado del átomo en la forma moderna se modifica ligeramente en comparación con su etimología original. Cambiamos el significado de las palabras todo el tiempo en el idioma inglés sin grandes problemas; eso es lo que le da moneda y matices no disponibles en otros idiomas.