No está seguro de lo que quiere decir con un gen inactivo, pero una vez que un gen pierde su función, tiende a decaer rápidamente (en términos evolutivos) a un pseudogen y muy rara vez desarrolla una nueva función: la biología prefiere hacer cosas nuevas que reutilizar algo roto. Originalmente diseñado para algún otro propósito.
La mayoría de los genes tienen múltiples funciones, por lo que las nuevas ‘necesidades’ de un organismo a menudo provienen de agregar funciones a un gen existente, o duplicar un gen y desarrollar una función variante (“neofuncionalización”).
Los genes no codificantes son una historia diferente. Muchos genes “no codificantes” codifican ARN funcionales en lugar de proteínas, por lo que no están inactivos. Hay algunos genes que no tienen un progenitor evolutivo obvio (no tienen una similitud de secuencia con ningún gen en ninguna especie) y estos pueden provenir de una mutación esporádica para crear un promotor en una región no codificante y, por casualidad, hacer un ARN o una proteína con cierta parcialidad. Función que luego puede estar sujeta a selección evolutiva.