¿Por qué siguen siendo 60 segundos y no 100 segundos mientras que muchas de las unidades se han estandarizado a 100 (por ejemplo, el punto de ebullición del agua, un metro equivale a 100 cm)?

Ok veamos que hacemos esto
Supuestos: la definición de un segundo es la misma
“La duración de 9,192,631,770 períodos de la radiación correspondiente a la transición entre los dos niveles hiperfinos del estado fundamental del átomo de cesio 133 ” – fuente: segundo

Vamos a tener un minuto de 100, NewMinute = 100s
Entonces, o bien tenemos una hora de 10 NewMinute o 100 NewMinute
Un día tendrá ahora 86.4 horas o 8.64 horas respectivamente. Recuerde que no podemos cambiar la definición de un día, el tiempo necesario para una rotación completa de la Tierra respecto a su eje .
Como cualquiera estaría de acuerdo, de los dos el primero parece más apropiado. Así que ahora tenemos 86.4 horas en un día.
Sería mucho mejor definir ModernDay = 10 días = 864 ModernHours para tener una escala de números enteros y continuar con el sistema decimal
Avanzando, definimos ModernYear = 365/10 ModernDays = 36.5 ModernDays

¿Estás empezando a darte cuenta del problema? Para continuar con el esquema decimal de las cosas, tendrás que cambiar las definiciones de años, décadas, siglos, milenios …
Si nos hacemos creer que las personas de alguna manera se acostumbran a este sistema, esto cambiará la forma en que estudiamos la historia. Porque no puedes enseñar a los muertos. Las cosas en la historia se hicieron de acuerdo con el sistema de los 60 y eso se mantendrá en la historia. Este nuevo sistema arruinará tantas costumbres, tradiciones.
Piensa en cómo tendrían que reprogramar las vacaciones, los festivales y tus cumpleaños también.

Podrías decir, está bien, solo tenemos un NewMinute = 10s y mantenemos la misma hora antigua = 36 NewMinutes
Pero si realmente no quería reemplazar el sistema por completo, ¿por qué molestar a un pobre Segundo?

Podrías decir de nuevo, está bien, cambia la definición de un segundo para que todo lo demás quede en su lugar.
Bueno, demasiado tarde. Ahora definimos un medidor utilizando un segundo. Ahora, no quieres molestar al pobre Metro, ¿verdad?