Básicamente tienes razón, es por los electrones. Hay ciertas configuraciones de electrones que son estables y otras que no lo son. Las razones para esto son muy complejas, pero el resultado final es que los átomos son generalmente más estables cuando tienen ocho electrones en su capa externa (excepto el hidrógeno, que es el más estable con dos).
Ahora los átomos pueden alcanzar la estabilidad de una de dos maneras. La primera es que realmente pueden ganar y perder electrones, esto es más común para los elementos que están a uno o dos electrones de la estabilidad. Por ejemplo, un átomo de sodio pierde un electrón y se carga positivamente. Un átomo de cloro gana un electrón para alcanzar la estabilidad y cargarse negativamente, cuando están tan cargados, se les llama “iones”. Los iones cargados positiva y negativamente se atraen entre sí y se mantienen unidos. Casi todos los iones se unirán entre sí en un grado u otro.
El otro método para la estabilidad es más complejo. Algunos átomos realmente compartirán sus electrones externos para ganar estabilidad. El carbono es el ejemplo clásico, tiene cuatro electrones en su capa externa y necesita ocho. Entonces, si el hidrógeno, por ejemplo, aparece, cada hidrógeno puede compartir un electrón, así que si cuatro átomos de hidrógeno se acercan lo suficiente, sus electrones se convierten en parte de la capa exterior del carbono, dándole esa magia mágica. Los electrones del carbono se comparten con el hidrógeno, dando a cada uno de ellos los dos que necesitan. Esto se llama un enlace covalente. En general, los elementos que tienden a formar enlaces covalentes los formarán fácilmente entre sí, en las circunstancias adecuadas. Es por eso que a menudo verás moléculas que incorporan carbono, oxígeno, hidrógeno y nitrógeno. Todos estos elementos tienen configuraciones de electrones que forman enlaces covelantes fácilmente entre sí, lo que facilita la reacción de los dos.